ФКУ СИЗО-3 УФСИН России по г. Москве построено в 1938 году как транзитно-пересыльный пункт для приема со всего Советского Союза заключенных, которые направлялись в г. Москву для строительства речного судоходного канала «Москва-Волга». До 1938 года, на месте нынешних зданий изолятора находилось несколько барачных деревянных сооружений, в которых и содержались заключенные.
Прием граждан руководящим составом учреждения осуществляется с 14:00 до 16:00.