Государственное бюджетное образовательное учреждение средняя общеобразовательная школа №1321 «Ковчег» является одной из первых общеобразовательных школ России, широко применяющих индивидуализированный подход в обучении, согласно концепции образовательной и социальной интеграции.
В школе организовано обучение в общеобразовательных классах, классах компенсирующего обучения. Для детей, имеющих медицинские рекомендации об обучении на дому по программе общеобразовательной школы, создаются условия обучения в структурном подразделении школы – отделении надомного обучения, в котором образовательный процесс организован в различных формах (в малых классах, в группах, индивидуально в школе или на дому), в зависимости от индивидуальных потребностей учащихся.