В 1999 году были открыты школы-новостройки № 1957 и № 1958. В 2003 году были реорганизованы: в № 1357 с углубленным изучением английского языка и № 1458.
Также в 1999 году был открыт детский сад № 2390 и в 2000 году – детский сад № 2403. С 01.09.2001 года в д/с № 2403 открыты группы для детей с нарушением зрения.
На основании решений родительской общественности и Управляющих советов было принято решение о присоединении ГБОУ СОШ № 1458, ГБОУ ДС № 2403 и ГБОУ ДС № 2390 к ГБОУ СОШ № 1357.
В 2013 году наши образовательные учреждения были реорганизованы в форме присоединения к Государственному бюджетному образовательному учреждению города Москвы средней общеобразовательной школы с углубленным изучением английского языка № 1357.
В 2015 году ГБОУ г. Москвы СОШ с углубленным изучением английского языка № 1357, ГБОУ г. Москва СОШ Российско-Словацкой дружбы № 1934, ГБОУ г. Москвы "Школа № 1910" и ГБОУ г. Москвы СОШ № 1968 были реорганизованы в форме присоединения в ГБОУ г. Москвы "Школа с углубленным изучением английского языка № 1357".
В 2015 году наша школа была переименована в Государственное бюджетное общеобразовательное учреждение города Москвы «Школа № 1357 «Многопрофильный комплекс «Братиславский».
Школа №1357 включена в список образовательных организаций, участвующих в образовательном проекте «Медицинский класс в московской школе».
В 2015 году многопрофильный комплекс «Братиславский» присоединился к проекту «Распределенный Лицей», о чем между Многопрофильным комплексом «Братиславский» и НИУ Высшей школой экономики было заключено соглашение о сотрудничестве. В рамках соглашения созданы профильные группы социально-гуманитарного, социально-экономического и естественно-математического направлений, в которых обучаются 64 учащихся.